Laboratorium Mikroanaliz Geomateriałów (Laboratorium Mikroskopii Elektronowej, Mikroanalizy i Dyfrakcji Rentgenowskiej)

• Międzyinstytutowe Laboratorium Mikroanalizy Minerałów i Substancji Syntetycznych
   
• Pracownia Preparatyki Próbek Cryo-SEM
• Pracownia Rentgenowska
• Środowiskowe Laboratorium Niskotemperaturowej Skaningowej Mikroskopii Elektronowej Cryo-SEM 

Laboratorium Geochemiczne i Geomikrobiologiczne (Laboratorium Geomikrobiologii i Geochemii Środowiska)

• Pracownia Geochemii nieorganicznej
• Pracownia Geochemii organicznej
• Pracownia Geomikrobiologii

• Pracownia Geomikrobiologiczna
•  Laboratorium Geochemicznej Analizy Elementarnej

Laboratorium Geologii Inżynierskiej, Geomechaniki, Hydrogeologii i Geofizyki (Laboratorium Geologii Stosowanej)

• Pracownia analizy termicznej i badań właściwości sorpcyjnych
• Pracownia mechaniki gruntów
• Pracownia geomechaniczna
• Pracownia badań polowych
• Pracownia geofizyczna
• Pracownia hydrogeochemiczna
• Pracownia antropogenicznych przekształceń środowiska

• Laboratorium Zakładu Geologii Inżynierskiej (LabZGI)
• Pracownia Mikroskopii Optycznej
• Pracownia Przygotowania i Separacji Minerałów
• Pracownia Separacji
• Pracownia Technologii Surowców Ilastych
• Środowiskowe Laboratorium Badań Ośrodków Skalnych