Laboratorium Geomikrobiologii i Geochemii Środowiska

(poprzednia nazwa: Laboratorium Geochemiczne i Geomikrobiologiczne)

W Laboratorium Geomikrobiologii i Geochemii Środowiska prowadzone są badania nad rolą mikroorganizmów w kształtowaniu procesów geochemicznych, biomineralizacją, biotransformacją faz mineralnych w strefach utleniających i redukcyjnych, toksycznością związków ksenobiotycznych i związków mineralnych względem mikroorganizmów, a także biodegradacją materii organicznej ze szczególnym uwzględnieniem praktycznych aspektów wykorzystania mikroorganizmów w biotechnologii i bioremediacji terenów zdegradowanych. Szczególny obszar badań stanowią zagadnienia związane z adsorpcją mikroorganizmów na powierzchni różnych materiałów mineralnych i związane z tym możliwości tworzenia się biofilmów, a także oznaczenia cytotoksycznych efektów tego typu oddziaływań. Dodatkowo prowadzimy również badania sorpcyjne, nanostrukturalne. Ponadto, zajmujemy się badaniami nad materiałami kompozytowymi do zastosowań środowiskowych.

Sprzęt:

  • Respirometr mikrobiologiczny firmy Columbus Instruments z możliwością analizy stężenia CO2, O2, CH4, H2, H2S oraz NO2;
  • Chromatograf Gazowy z detektorem FID Thermo GC Ultra;
  • Chromatograf Gazowy z detektorem MS (single quadrupole) PerkinElmer Clarus 500 wyposażony w dodatkowo detektor ECD;
  • Chromatograf Cieczowy HPLC Thermo SpectraSystem z detektorem dual-wavelenght Detector UV2000;
  • Spektrofluorymetr Thermo Lumina;
  • Zestaw do chromatografii TLC;
  • Spektrometr UV-Vis Thermo seria Genesis oraz Hach DR6000;
  • ICP-OES PerkinElmer Optima 5300 DV;
  • Spektrometr Adsorpcji Atomowej (AAS) firmy PerkinElmer AAnalyst 300 w tym momencie wyposażony w lampy do analizy Si, K, Na, Mg, Ca, Al., Ti, V, Cr, Mn, Fe, Se, As, Li, Cd, Co, Zn, Sn, Zr, Mo, Cu, Hg;
  • Mineralizatory mikrofalowe Anton Paar Multiwave;
  • Zestaw do ekstrakcji do fazy stałej (SPE);
  • Mikroskop optyczny Nikon LV100N POL z przystawką do badań refleksyjność witrynitu;
  • Sprzęt drobny: liofilizatory, cieplarki, inkubatory, autoklawy, dejonizatory, wyparki, homogenizatory ultradźwiękowe, sterylizator, komora laminarna klasy BSL-2, przenośny licznik geigera-müllera, przenośny tlenomierz, pH-metry, konduktometry.

Usługi i Badania Komercyjne:

  • Analizy mikrobiologiczne w zakresie oznaczeń liczby mikroorganizmów i grzybów, a także nietypowych oznaczeń takich jak miano bakterii redukujących siarczany, liczba mikroorganizmów zdolnych do biodegradacji substancji ropopochodnych, liczba mikroorganizmów autotroficznych utleniających związki siarki;
  • Aktywność biochemiczna próbek środowiskowych określana na podstawie badań enzymatycznych oraz respirometrycznych;
  • Oznaczenia enzymatyczne w tym analizy z zastosowaniem substratów fluorescencyjnych;
  • Oznaczenia zawartości węglowodorów alifatycznych i aromatycznych oraz kwasów tłuszczowych (FAME) metodami chromatograficznymi m.in. dla potrzeb analiz geochemicznych oraz skażeń środowiska;
  • Analizy biodegradacji różnych związków organicznych na podstawie badań respirometrycznych oraz z wykorzystaniem metod chromatograficznych;
  • Wykrywanie metali ciężkich i śladowych w roztworach i próbach środowiskowych;
  • Oznaczenia refleksyjności witrynitu;
  • Pomiary punktu izoelektrycznego;
  • Obrazowania i analizy próbek środowiskowych i biologicznych z wykorzystaniem technik mikro wiązkowych.

KIEROWNIK:

  • Mgr Marcin Daniel Syczewski (starszy technik)
    E-mail: Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript.
    Telefon: (+48 22) 55 40 321; +48 604 079 658
    Pokój: 2029

PRACOWNICY:
  • Dr Michał Karger (starszy specjalista badawczo-techniczny) 
    E-mail: Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript.
    Telefon: (+48 22) 55 40 322
    Pokój: 2091
  • Mgr Filip Owczarek (starszy technik)
    E-mail: Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript.
    Telefon: (+48 22) 55 40 414
    Pokój: 2031

 

 Realizowane projekty:
  • Naukowe:
    • Viral proxies from modern carbonate environments (NCN, OPUS 18, 2019/35/B/ST10/02190)
    • Virus-mediated precipitation of mineral phases (project NCN OPUS 2019/35/B/ST10/00719)
  • Komercyjne:
    • „Synergia badań biogeochemicznych, geologicznych i geofizycznych w poszukiwaniu węglowodorów we wgłębnych fałdach Karpat fliszowych”. Projekt „SynerGa” (POIR.04.01.01-00-0036/18) – NCBiR oraz PGNiG S.A.
 

Publikacje:

  • Borkowski, A., Gutowski, Ł., Syczewski, M., Cłapa, T., Czerwonka, G., 2018. Adaptation of bacteria Escherichia coli in presence of quaternary ammonium ionic liquids. Ecotoxicology and environmental safety 164, 370–378.
  • Borkowski, A., Kiciński, W., Szala, M., Topolska, J., Działak, P., Syczewski, M.D., 2020. Interactions of Fe–N–S Co-Doped Porous Carbons with Bacteria: Sorption Effect and Enzyme-Like Properties. Materials 13, 3707.
  • Borkowski, A., Syczewski, M., Czarnecka-Skwarek, A., 2019. Ionic liquids strongly affect the interaction of bacteria with magnesium oxide and silica nanoparticles. RSC Advances 9, 28724–28734.
  • Czerwonka, G., Gmiter, D., Guzy, A., Rogala, P., Jabłońska-Wawrzycka, A., Borkowski, A., Cłapa, T., Narożna, D., Kowalczyk, P., Syczewski, M., 2019. A benzimidazole-based ruthenium (IV) complex inhibits Pseudomonas aeruginosa biofilm formation by interacting with siderophores and the cell envelope, and inducing oxidative stress. Biofouling 35, 59–74.
  • Khomutovska, N., Jerzak, M., Kostrzewska-Szlakowska, I., Kwiatowski, J., Suska-Malawska, M., Syczewski, M., Jasser, I., 2017. Life in extreme habitats: diversity of endolithic microorganisms from Cold Desert Ecosystems of Eastern Pamir. Polish Journal of Ecology 65, 303–319.
  • Kiciński, W., Szala, M., Cłapa, T., Syczewski, M., Borkowski, A., 2018. Interactions between bacteria and heteroatom-modified nanoporous carbon: The influence of nitrogen and sulfur doping. Carbon 127, 479–490.
  • Sekudewicz, I., Dąbrowska, A.M., Syczewski, M.D., 2021. Microplastic pollution in surface water and sediments in the urban section of the Vistula River (Poland). Science of The Total Environment 762, 143111. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2020.143111
  • Słowakiewicz, M., Borkowski, A., Syczewski, M.D., Perrota, I.D., Owczarek, F., Sikora, A., Detman, A., Perri, E., Tucker, M.E., 2021. Newly-discovered interactions between bacteriophages and the process of calcium carbonate precipitation. Geochimica et Cosmochimica Acta 292, 482–498.
  • Syczewski, M.D., Borkowski, A., Gąsiński, A., Raczko, J., Mordak, K., Grądziel, I., Krzesicka, M., Kałaska, M., Siuda, R., 2020. Phosphogypsum and clay mineral/phosphogypsum ceramic composites as useful adsorbents for uranium uptake. Applied Geochemistry 123, 104793.
  • Xifeng, L., Gil, G., Yan, L., Xuemei, H., Syczewski, M., Bagiński, B., Ting, F., Xiaochao, S., 2021. Timing of formation and cause of coloration of brown nephrite from the Tiantai Deposit, South Altyn Tagh, northwestern China. Ore Geology Reviews 103972.

Sekretariat WG3:

Telefon: (+48 22) 55 40 300; (+48 22) 55 40 305
Fax: (+48 22) 55 40 001
Pokój: 2076
E-mail: Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript.


Godziny otwarcia:
poniedziałek - piątek godz. 800 - 1600